十月初三日（丁酉），浦霖奏言：川兵赴閩，自湖北荊州順流前進，應由湖南巴陵縣經過，臣先經飭令地方官將一切官兵食用薪蔬等物，寬為預備，隨到隨即應付，不令兵丁一人上岸，以免耽延，並可無虞滋事。並飭委署岳州府李之栻、署岳州城守營參將伊靈阿督率文武各員，分駐沿江，往來照料。茲於九月十七日全數出境。成都將軍鄂輝亦於是日督押末起兵船，晝夜前進，並無停留，兵丁等亦極為安靜。奏入，報聞。

初四日（戊戌），福康安奏言：自入閩省以來，沿途不見柴大紀文報，知諸羅受困更為危急。及閱看恆瑞奏稿，所帶赴援之兵，於二十五日行至鹽水港，不能前進，尚未與柴大紀會合。而常青株守府城營盤，南路賊匪仍行四出攻擾。臣沿途細加探訪，雖傳聞之辭不一，大約南北兩路官兵，僅可支持防守，至今尚未得手。臣於十七日馳抵廈門，晤見李侍堯詢以賊匪情形，亦言近日屢接台灣各官稟報，賊勢似更猖獗，將各稟與臣閱看。內臬司李永祺稟稱：府城周圍十里之村莊，盡被脅從，不惟諸羅受困，即郡城亦在圍中。郡城兵丁，除撥往諸羅七千名外，其餘呈報病故者，殆無虛日；現在臥病者，尚有一千數百名，兵勢日益餒怯。南潭賊匪，距城甚近，其地附近大穆降、蔦松、岡山等莊，皆係賊匪聚處，此時郡城甚為可慮。又永福等稟稱：諸羅城西十里，地名湯元店，賊匪眾多，歷次赴援之兵，皆於此處被截。今蔡攀龍等救援諸羅，會同遊擊楊起麟等前進，行至該處亦被賊人阻截，惟蔡攀龍、孫全謀、邱能成帶兵七百名到縣，其餘多有損失。副將貴林、遊擊楊起麟等，聞已被害。附近鹽水港之樹林頭、鹿仔草、新店等處，於二十六、二十八、二十九等日，已被賊匪搶佔，鹽水港莊民，大半從賊各等語。臣查各員所稟鹿仔草等處被賊佔據及將弁兵丁損失各情節，俱係巡檢邵宗堯稟報之詞，或係該員等張大其詞，亦未可定，必須親至該處目擊情形，方可相機籌辦。竊思台灣賊匪，原係烏合之眾，易聚易散，但該將軍等調度失宜，官兵多有損失，賊勢固結蔓延，日肆猖獗。而該將軍等節次奏報之摺，僅以支持堵禦情節，敷衍塞責，而於賊匪出沒屯聚實在情形，及官兵打仗損失之數，並未詳悉陳明，一味支吾掩飾，以致久未蕆功。現在台灣地方，據臣所聞，自鳳山以至彰化要隘處所，多被賊匪佔據，道路梗塞；近山一帶，如布袋尾、雙口坑、大穆降、九芎林、頭湖、二湖、三湖，皆係賊巢。是以南北兩路賊匪，處處相通，而官兵各守一方，相距遼遠，聲勢轉不能聯絡。且進兵道路窄狹，數人不能並行，賊匪潛伏道旁、莊內，俟我兵經過，行至半途，即突出從中抄截。領兵將弁不知探明路徑，設法防備，以至累中賊匪狡計。即奮勇如蔡攀龍，救援諸羅亦不能全師直抵縣城，是其明驗。看來，賊匪不過鬼蜮伎倆，慣以中途邀截，若我兵探視賊蹤所至，沿途搜捕，連得數次勝仗，其技立窮。無如自用兵以來，辦理不合機宜，益長賊人之智，全郡官弁兵丁，俱不免心懷惶懼。現在鹿仔港一帶，藍元枚已經病故，賊人聞知，必致乘虛窺伺。該處止有普吉保、李化龍在彼，臣若遙揣情形，指示一切，又恐與該處形勢不盡符合，惟有速渡鹿仔港，立定主見，以鎮人心，而壯軍威。臣前於途次，已飛檄各營嚴切曉諭，申明軍紀，盡改委靡之習。一到鹿仔港，即選擇勇往弁兵，激勵出力義民，相度地勢，整兵奮勇前進，務將賊匪屯聚相聯之處，併力截斷，痛加剿殺，使其首尾不能相顧。官兵所過之地，不致旋通旋塞。即當酌量情形，或帶兵直抵諸羅，或進逼大里杙賊巢，則諸羅之圍不攻自解。要領既得，乘勝直前，雖賊匪眾多，無難剋期殲滅。至臣前赴鹿仔港，本應由蚶江配渡，聞李侍堯所備船隻、馬匹、帳房等項，先已齊集廈門，若復調往蚶江，轉稽時日，廈門至鹿仔港，海道本屬相通，自應即由廈門前往，以期迅速。惟現在颶風頻作，連日不止，茲已於十九日拜摺後登舟，即在大擔門候風。一俟風信稍順，即刻放洋逕渡。此時仍聲言由鹿耳門前進，臨時再諭知船戶，令其前赴鹿仔港，使賊匪猝不及防，亦聲東擊西之一法。

同日，李侍堯奏言：閩省辦理軍需，除節次解往台灣南北各路軍營一百五十餘萬兩外，其內地辦理兵差夫船各價，及一切製備軍裝、借給官兵俸餉等項，支用亦多；寧可寬為備辦，懇再撥銀二、三百萬兩，以備接濟。至本省歲需官兵俸餉等項一百四十萬餘兩，藩庫亦屬不敷，據布政使覺羅伍拉納詳請於鹽道庫內撥銀四十萬兩，以供支放，似亦應照詳動撥。再鹿仔港所運糧餉、鉛藥等項，本俱充足，今更當源源運送，務期寬裕。惟是該處糧餉，向來祗係同知等官辦理，今將軍、參贊等全向此路，將來續調之川、黔兵到來，亦俱由此進剿，則糧餉不可無大員經理，臣擬即檄臬司李永祺，由海道前赴鹿仔港。但據福康安告稱，此時尚聲言由鹿耳門前進，臣俟福康安開洋後，再飭知該臬司前往，仍須慎密，不可稍露端倪。其府城，有永福、楊廷理等料理，亦可不致有誤。惟官兵屢次赴援諸羅之後，該處存兵又稍覺單薄。查臣所派赴援鹽水港之兵三千名，已先有一半放洋，其續到之一千五百名，現在總兵鄭國卿帶領，尚在廈門守風。臣與福康安面商，將此一千五百兵，仍赴常青處協助，則南路兵力亦益厚集，足資剿殺。均奏入。

上命軍機大臣傳諭福康安、常青、恆瑞、柴大紀、李侍堯、孫士毅曰：福康安所奏台灣府城，賊匪現在窺伺一節，俱係地方官稟報之語。但，前此蔡攀龍帶兵援應諸羅時，先據地方官稟報，已將道路打通，直抵諸羅，復自城內殺出；而續據恆瑞、李侍堯奏報，則蔡攀龍抵諸羅後，仍被賊梗阻道路，並未能出城剿殺，可見該處地方官稟報之詞，好否皆未必盡係確實。惟常青處兵力雖厚，但先後派撥魏大斌、蔡攀龍等援應諸羅，已不免分勢，而恆瑞又帶兵三千赴鹽水港，常青處現存之兵，以分而見單，所存無幾，賊人乘間侵擾，亦屬事之所有。常青前經具奏，親帶官兵往南潭、中洲等處搜剿賊匪，如府城附近賊勢稍增，想常青自揣兵力有限，不得直前搜捕，亦斷不能輕離該處。

府城，從前未添兵以前，尚能守護無虞，又有常青在彼，自當更無他慮。總須俟常青等奏到，方得的實。看來常青、柴大紀兩處局面，尚能支持防守，所慮官兵或因屢有挫失，不免氣餒，於剿捕未能得力。今福康安即由廈門配渡前赴鹿仔港，仍聲言由鹿耳門前進，使賊匪猝不及防，所辦甚好。其所稱常青等調度失宜，官兵多有損失，及南北兩路賊匪，處處相通，而我兵相距遼遠，聲勢不能聯絡各情節，實為切中肯綮。福康安於抵鹿仔港，振作士氣，鎮定人心，探視賊蹤所至，沿途搜剿，實為此時要著。至賊人狡猾伎倆，往往於官兵過後，阻截道路，今福康安擬將賊匪屯聚相聯之處，併力截斷，使其首尾不能相顧，是即因賊人之巧計，用以攻賊，俾官兵所過之地，不致旋通旋塞，深合機要。此事初起時，若早派福康安前往督辦，自早已蕆功。乃黃仕簡、任承恩貽誤於前，而常青等又茫無把握，以致曠日持久，尚未辦理完結，朕悔之無及。今福康安到彼，聲威壯盛，又有巴圖魯侍衛章京等百餘人，帶領已到蓄銳之兵進剿。且續調之屯練二千、黔兵二千，廣西兵三千、約計十月底俱可到齊。此項兵丁內，川、黔兩省兵最為趫捷，臨山陟嶮，驍健可用。雖廣西之兵稍遜於此二省之兵，亦於南方潮溽之地，水土相宜，尚可期得力。又李侍堯赴鹽水港兵三千名，今據奏已先有一半放洋，其一千五百名，現經總兵鄭國卿帶領候風過渡。合之常青、恆瑞、柴大紀、普吉保等所帶之兵，統計不下五、六萬，是先後派調之兵為數已多，加以府城及鹿仔港招集義民，自足敷剿捕之用。況我朝定鼎之後，止用滿洲勁旅，所向剋捷，無不以少擊眾，戡定海內，奄有萬方。諒此等么■〈麻上骨下〉草竊，即云為數稍多，祗不過一時烏合，以現在如許多兵統領進剿，豈尚有不敷；即云遍地皆賊，斷無須一兵抵一賊之理。福康安惟當督率將弁，奮勇前進，勉圖奏績。前經降旨令李侍堯、孫士毅於福建漳、泉及廣東潮州等處，添募官兵，以備調遣，該督等竟當廣為招募。粵東與福建境壤毗連，設遇有撥調，可就近派往。而附近游手無籍之民甚多，令其食糧充伍，既可安戢地方，又可豫備調撥。福康安察看情形，若剿捕賊匪實有必須再行添調之處，閩省、粵東之兵，不妨一面奏聞，一面即就近撥調，以期應手。福康安計出萬全，上天必垂嘉佑。惟福康安摺內所稱沿途搜剿一節，賊匪到處屯聚，所過村莊，民人多被迫脅。今福康安統兵進剿，其經過地方，固應乘勢掃除，不使於官兵過後潛出滋擾，但所過村莊，若悉行殲戮，恐一處被官兵剿洗，而他處聞風畏懼，轉為賊拒敵，是驅使從賊，轉堅其助逆之心。若不留心防範，而於所過村莊聽其聚處，又恐奸猾之徒，於官兵過後，生心梗阻，致為肘腋之患。福康安務須隨時體訪，加意密防，使良善得安其心，而奸宄無由逞其伎倆，此為最要。再如鹿仔草等處，本係楊起麟、邱能成在彼駐守，嗣因調往援應諸羅，致該處兵單，為賊所據。福康安統兵前進，所過之處，其原派駐守官兵，不可輕易撤調。即鹿仔港，亦應遵照昨降諭旨，於普吉保、李化龍二人內，酌留一人駐守，以免疏虞。至京營勁旅，朕非靳於調撥，推念自京至閩，道里遙遠。即如川黔等調派之兵，到彼尚須時日，若調動京兵，更屬緩不濟急，兼恐有駭聽聞。且各省官兵到台灣後，尚因彼處氣候、水土不能服習多有染患疾病者，若京兵到彼，更不相宜。即派往，亦恐用非所長，不能得力，是以不復調遣。福康安意以為何如？至貴林、楊起麟二人，是否實係陣亡？著即行查明速奏。

上命軍機大臣傳諭李侍堯曰：前因賊首林爽文糾眾謀逆，罪大惡極，該犯係漳州人，其祖墳自必近在漳州一帶。早經降旨令李侍堯密委妥員，將林爽文祖墳先行刨挖，剉骨揚灰，以損賊勢。今月餘尚未據該督覆奏。著傳諭李侍堯，將於何日查明林爽文祖墳處所及如何辦理之處，迅速覆奏。

上又諭內閣曰：成都將軍鄂輝，現在帶領四川屯練兵丁赴台灣剿捕賊匪。鄂輝久歷行陣，於軍旅較為諳習，亦著授為參贊，協同福康安悉心籌辦進剿，以期迅奏膚功。

上又諭內閣曰：現在台灣剿捕逆匪尚未竣事，所有軍需等項動用較多，著該部於鄰近福建各省分酌撥銀三百萬兩，令該督撫派委妥員，迅速解往閩省備用。

同日，何裕城奏言：川省屯練降番兵二千名，先經副將那蘇圖帶領頭起兵五百名，於九月十八日抵江西九江府境，當即起程前進。茲松潘鎮臣穆剋登阿帶領二起五百名，於二十一日抵九江境，即於次早起程前進；成都將軍鄂輝帶領三起五百名，於二十四日抵境，亦於次早起程；副將張芝元帶領四起五百名及額外多帶降番三十一名，於二十六日抵境，亦即於次早起程，並由南康、南昌、饒州、廣信等府前進。經臣每起於例給口糧、鹽菜之外，量給食物錢文，分別犒勞。該屯番等趕緊行程，甚屬踴躍，亦極安靜。臣仍飛飭臬司額勒春，於南昌省城上船處督率照料，並飭藩司李承鄴，於鉛山縣過嶺出境處，親為妥協經理。再湖北省協濟閩米十萬石，分作四起，由江西五福地方起岸轉運。其頭、二起米五萬石，先已入境換船前進。今三、四起米五萬石，亦於九月十五、十九等日，先後抵江西九江府境。臣派員協同各地方官，護送趲催，行抵鄱陽湖口，一俟風順，立即渡湖換船前進，不致少有遲誤。奏入。

上命軍機大臣傳諭孫士毅、孫永清、李慶棻曰：廣西、貴州兵丁，前據孫永清、李慶棻奏，已於九月初九、十六等日，全數出境，諒日內自可陸續趲發。已節經降旨，催令遄行。現在福康安已抵廈門配渡，亟須官兵接濟，合力攻剿，著沿途各督撫於前項官兵抵境，務須妥為照料，趲程前進，愈速愈妙。

初七日（辛丑），福康安、海蘭察同奏言：登舟數日，風信靡常，現在大擔門守候。日內若得旁面稍順之風，可以折戧行走，即令開駕放洋。再，台灣各處義民隨營打仗，接濟諸羅糧食，最為急公出力。茲賞給義民頭目官職，並將乾隆五十三年應徵錢糧，通行蠲免。現已發給廈門道廳等，刊刻謄黃，送至舟中，一經登岸，即於南北兩路普行張挂。並一面出示剴切曉諭，被脅民人亦必聞風投出。現在調派漳州兵丁二千名，與賊匪同鄉，多言其不可深信。然此時祗可分派各營、各隊嚴加約束，仍不可稍露端倪。至義民人數眾多，難保無賊人混入其中，亦當責成義民頭目，實力查察。奏入。

上命軍機大臣傳諭福康安、常青、海蘭察、李侍堯曰：海面九月內風色不正，此原不可過於焦急、輕易冒險，但十月向係平順易渡。福康安於九月十九日在廈門登舟，候風過渡，計此時早交十月，想已得有順風，久經放洋，前抵鹿仔港矣。台灣剿捕賊匪，前後派調官兵不為不多，而常青等運籌調度不能得有把握，以致東派西撥，兵力見單，賊勢尚在各路滋擾。幸而朕先事豫籌，早經降旨將四川屯練及貴州、廣西兵，豫為調度。此時台灣各路之兵，未免因日久稍疲，而新調川、黔、廣西之兵，皆係生力，待其接續前到，正資剿捕之用。此刻，雖因守風稍為稽待，然自此兵威壯盛，機宜湊合，未始非成功先兆。福康安於此時，轉不必過於焦急，輕易涉險也。李侍堯派令鄭國卿帶往本省兵三千名，亦在大擔候風，自即與福康安一同渡洋。此內一千五百名，前據李侍堯奏，擬撥常青處。此時福康安到鹿仔港後，即日相機進剿，其鄭國卿所帶兵三千名，竟可全數俱赴鹿仔港，不必撥往南路，更為壯盛。再七月間曾據常青奏，遊擊黃鳴鳳帶領弁兵、義民，在鹿耳門洋面巡緝，瞭見賊船八隻，隨率兵民追捕，殺賊二十二人，餘匪逃竄，賊船、賊寮盡被焚燒等語，曾諭令常青等，於各隘口分派員弁實力巡查，嚴密防範。何以前此賊匪潛出滋擾時，當被巡緝官兵即時追補剿殺，而近日鹿仔草一帶近海口岸，轉被賊匪肆出騷擾，焚搶屯佔，並不能隨時剿捕？著福康安到彼後，嚴飭沿海各隘口官弁、兵丁等，務須梭織巡邏，認真查緝，毋使賊匪得以乘間滋擾，劫奪船隻。至普吉保前奏俟李化龍抵鹿仔港後，即親帶官兵進擊西螺、斗六門，正欲觀其後效，乃距今已閱兩旬，其如何進兵攻擊，及西螺一帶曾否打通道路接應諸羅之處，並未據有續奏。或又係因風阻，亦未可定。普吉保在彼帶兵，是否實能奮勇出力？著福康安秉公查明，據實覆奏。人才難得，福康安亦不必因有前旨，豫存成見。

同日，阿桂奏言：福康安進攻大里杙，不特廓清道路、攻圍賊巢須用多兵，即留防後路，以及沿途護送糧餉、火藥等項，在在咸資兵力。且福康安與海蘭察等久歷戎行，聲威素著，非常青等可比，必得一臨其地，每戰必剋，所向披靡，方足以寒賊膽而整軍威。若急於前進，設未能長驅直入，途次稍有濡遲，不副眾望，所關匪細。台灣節次調往之兵雖已不少，但分路剿捕及派撥防堵，勢已見單。且其中亦少可用之兵，而鹿仔港原駐兵力，又不及府城。至義民、熟番等，各護其身家，大約以之守禦則可，資其力以之攻剿，則但能助勢。即如剿賊以來，義民、鄉勇到處打仗，傷亡俱較兵丁甚少，於此可見。徐鼎士帶兵不過二千餘名，即由大甲溪進剿，恐亦難深恃。計福康安到廈門蚶江一帶，當在九月二十左右，台灣每年九月、向多颶風，難於配渡。若福康安略需等候放洋，則現調之屯練降番與黔省兵丁隨後可到，福康安親帶前往，聲勢較壯。若福康安到廈門蚶江一帶，即揚帆逕渡，似宜就該處現有兵力，先於諸羅、鹽水港等處剿殺匪黨，廓清後路，俟屯練降番與黔兵到齊，兵力稍充，整頓前進時，再飭知徐鼎士由大甲溪剋期夾攻，庶搗穴擒渠，可以得手。就臣愚見，台灣現在剿賊，必得可用之兵二萬，專為搗穴擒渠之用，辦理方有把握。福康安到彼，如原有及現調各兵足敷攻剿，自不肯再請添調。儻兵力尚不敷用，仍需奏請添調湖廣兵丁，或竟於原備楚兵之外，尚需續添黔兵數千，仰懇皇上俯從准其調用，並飭遄進。緣台灣炎熱雨濕，官兵速到，總得於春令完事，則辦理不致棘手。奏入，報聞。