曹元弼在易学方面的著作主要有三种，《周易学》八卷、《周易郑氏注笺释》二十八卷、《周易集解补释》十七卷。《周易学》，条理《周易》之义例。《周易郑氏注笺释》，以郑玄注为主，参详诸家，阐发经义。因为《周易郑氏注笺释》卷帙浩繁，不利于初学，又著《周易集解补释》，以唐人李鼎祚编著的《周易集解》为纲，加以补释。《周易集解补释》成书最晚，先补《周易集解》未收之古注，然后将诸家之注，条分缕析，详加阐发，以己意贯

七卷。曹元弼撰。是书分七卷:一,明例;二,要旨;三,图表; 四. 会通;五.解纷;六.缺疑;七. 流别。明例卷又分三目:一、孝经脉络次第说;二、孝经微言大义略例;三、陈氏澧说孝经要略。要旨卷述《中庸》、《史记》、《汉书·艺文志》、郑玄《六艺论》以及陶渊明、黄道周、阮元诸家孝经说,另就书中某句某节加以阐释。图表卷分今文各本表、古文各本表,认为日本所传郑注孔传为伪本。会通卷以群经证本经,而见其相通。

三卷。曹元弼撰。与《孝经学》的略释大义不同，《孝经郑氏注笺释》极尽精详。在该书中，作者重构了《孝经》与六经的关系，并且以《孝经》学的“爱敬”之理贯穿、统摄六经，建构了一个新的经学体系。简言之，就是以《孝经》会通六艺。曹元弼的种种努力，是为了重建在近代变革中被冲击和瓦解的经学。今据民国二十四年（1935）刊本整理。

古文尚书郑氏注笺释四十卷（上） 曹元弼撰 影印复旦大学图书馆藏稿本 古文尚书郑氏注笺释四十卷（下） 曹元弼撰 影印复旦大学图书馆藏稿本